В союз вошли 10 стран: Алжир, Египет, Замбия, Республика Конго, Ливия, Мавритания, Марокко, Судан, Танзания и Тунис. В скором времени количество государств-членов Союза может увеличиться: по словам учредителей, он открыт для взаимодействия со всеми африканскими государствами. Основная задача новой организации - объединение сил тысяч выпускников стран Африки, взаимопомощь и обмен опытом. Одной из главных целей является содействие активизации российско-африканского взаимодействия. Важное место в деятельности организации займут межуниверситетские контакты.
Первым председателем Панафриканского союза стал представитель марокканского королевства. Пост генерального секретаря достался Египту, а должность вице-председателя – делегату из Туниса. Переизбрание руководства назначено на 2019 год.